南京市高淳人民醫院是揚州大學醫學院、江蘇建康職業學院附屬醫院，南京醫科大學、江蘇大學的教學醫院，江蘇省老科技工作者協會衛生分會技術合作醫院。連續十五年蟬聯南京市“白求恩杯”競賽第一名，多次被評為省市文明單位。同時，醫院與第三軍醫大學大坪醫院、南京鼓樓醫院、江蘇省人民醫院，以及美國Adoocat集團霍普金斯兒童醫院、意大利都靈BOSCO醫院等國內、國際一流醫院建立了技術合作關系。醫院于2005年通過ISO9001質量管理體系的認證，曾連續十五年蟬聯南京市“白求恩杯”競賽第一名，多次獲南京市“醫院管理年”活動第一名，2014年12月，醫院再次高分通過南京市二級甲等醫院復審。